STNext: Sequence Searching

Deze workshop richt zich op het vinden van sequenties in de STN databases.

De REGISTRY database bevat meer dan negentig miljoen verbindingen. Tweederde hiervan zijn sequenties. Het zoeken op sequenties kan op verschillende manieren. Op tekst zoeken met commando’s is daar natuurlijk één van, maar ook het zoeken via algoritmes als BLAST en FASTA is een mogelijkheid. In deze workshop leren wij u de basis hoe u een aantal van deze technieken kunt gebruiken.

Inhoud cursus:
• Inhoud CAS REGISTRY, DGENE, USGENE, PCTGENE database
• Zoeken op lange aminozuur sequenties
• Zoeken op korte aminozuur sequenties
• Zoeken op nucleotiden
• Gebruik van CAS ROLES


Benodigde voorkennis:
U hebt kennis van de STN basiscommando’s.

Deze meer gespecialiseerde cursus, wordt op aanvraag georganiseerd. U hoeft dan bijvoorbeeld niet meer enkele maanden te wachten totdat de cursus weer aan de beurt is. U kunt een datum afspreken, die u het beste uit komt. Neemt u hiervoor contact op met de Cobidoc helpdesk (088-6880333 of helpdesk@cobidoc.nl).